剧情：
世间人多如天上之星，邂 逅亦多如天上之星，紧接着的……是离别 刺耳的警报声骤 然响起，通过无线电传入每个人的耳中。 八号殖民地“白雪公主”正遭到突 如其来的袭 击，防御力量正被迅速瓦解 。与此同时，“白雪公主 ”内部突然出现几个头 带斗笠象僧侣一样 的人开始追杀研究员……当入侵的机器人突入“白雪公主”的时候，里面已经血流成河。那些僧侣们留下一句“你来迟了一 步，复仇者，你还 未够道行 啊”，就神秘的消失了。 接到求救的联合宇宙军战 舰迅速赶到， 但是“白雪公主”各处已经开始发生爆炸。 入侵的机器人留下的唯一踪迹是玻色子跳跃前 的模糊影响，而这种跳跃应该是比它大几十倍的大 型战舰才能做到了，幽灵机器人的说法因此不径而走。 因为四个殖民地连续发生爆炸，地球统合军成立意外调查委员会负 责调查次事，但他们 不信有关机器人玻色子跳跃的 事情，还把宇宙军排除在外。为此联合宇 宙军自行展开调查，计划从玻色子跳跃系 统入手，这就牵涉到 葫芦计划 。葫芦计划是在人类活动频繁的宇宙区 域内的一些殖民地之间 建立玻色子跳跃通道 ，这样拥有次元歪曲防壁可以经受跳跃冲击的战舰 就可以通过郁金香方便的 来往于各地。按照计划， 星野琉璃少校任舰长的机动战舰NADESICO·B奉命出发前往葫芦计划的中枢——殖民地“ 天照”。 在殖民地“天 照”，琉璃 受到当地指挥官的故意怠 慢，于是她将计就计，表面 上接受殖民地 安排的所谓“ 检查”，暗 地里利用NAD ESICO·B里的超级电脑“思 兼”侵入“天照”的电脑系统，结果不仅发现有葫芦计划正式设计 图上没有的玻色子跳跃通道 ，还发现大量非正式的玻色子跳跃的人体实验记录。 正在这个时候，“ 天照”内 的电脑系统出现 反常现象，电子屏幕上充满了OT IKA的字样，无法正 常工作。“OTIKA反过来就是 AKITO，也就是明人”，突然想到这点的琉璃似乎 预感到什么，“那是 暗号，还是巧合？ 但是那个人……明人和由利加已经死了呀。” 入侵者终于出现了， 在玻色子的灿烂光芒中。连 NADESICO也无法 识别的入侵机器人虽然只有 十来米长，但是激动性和威力却非常强大。这时琉璃果断地命令NADESICO进入战备状态但不参与 “天照”的保卫战斗，而是静观其变。另一方面，天照出动的是凉 子带队的爱特巴里斯队，入侵者似乎抵挡 不住迎击而想要撤退，可是 谁知这是调虎离山之计。当爱特巴里斯队被引到殖民地外圈的时候，一艘不明 战舰突然通过时空跳跃出现，用重力波炮攻击使殖民地 警卫队损毁严重，入侵机 器人也乘乱进入了殖民地内部。 “你认 识的天河明人已经死了，我想你收下他曾生存的 证据”星野琉璃，被 称为“电子的妖精”的女孩 ，NADESICO·B的舰长琉璃 超级电脑思兼 NADESIC O·C= 无敌 最后的 决斗就在眼前，明人乘坐的黑色机器人蓄势待 发 “他会回来的，如果他不回 来，我们便追 上去，因为那个人对我们 很重要” 这时在殖民地指挥部，一伙自称火星后 继者的人发动政变占领了“天照”，而另一方面紧随入侵机器人进到基地 内部的凉子在那里见到了上次战争中地 球和木星都想得到的火星遗迹——玻色子跳跃 的黑匣子。黑暗中突然传来一阵摄人心魄的铃声，“危险！ ”，听到了黑色机 器人驾驶员的警告，凉子侥幸躲过了偷袭。偷袭者出现了，他们就是上次 在“白雪公主”大开杀界的那些僧侣，也是火星后继 者背后的影子——心黑手辣的暗杀者。僧侣的首领向 黑色机器人发话了，“你要死在 自己的妻子面前吗”，随着 这话音，遗迹缓缓展开，出现 在里面的竟然是由利加。 原来由利加没有死啊，凉子想，那么明人呢？刚才黑色机器人驾驶 员的声音怎么这么耳熟？啊 ！是明人，他们都还活着！ 混战中凉子被赶 来支援的赤月 救出，明人和由利加下落不名。“天照 ”终于被火星后继者给 爆破了，之后火星 后继者占据了火星极冠，在那 里和他们的支持者 集结，想要依靠遗迹的力量和统合军对抗 。 通过调查，大家得知火星后继者造就和 尼鲁加路的竞争对手联合起来，希望通过掌握波色子跳跃通道的“葫芦计划”来达到起野心。为此需要那些 为数不多的A级 跳跃者来做玻色子单体跳 跃的领航员，明人和由利加就是在蜜月旅行的时候被火星后继者绑架 了的，当局为了保 密才宣称他 们不幸遇难。后来明人侥幸逃脱了出 来，一直在暗中和火星后 继者战斗。 面对新的威胁，琉 璃等人奉命回 地球召集人手，已经退 役的原NADESICO 成员又重新聚集起 来，更有不少年轻人加入。然而，到达地球的不只是他们……战斗即将爆发，结局到底 是什么样的呢？ 想到那个神 出鬼没的东西，印颜的心又剧烈跳动起来，“本来，昌长老 感觉能按住那条大尾 巴，可是，不知怎的，它突然 又厉害起来，然后，那小冥兽，好像 鬼魅一般，借着地利，连着抹了西才他们的脖子，昌长老没办法，才完全放开了身体的封印。”
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